Growth rate-corrected (GR) dose-response metrics across a panel of 71 breast cancer cell lines treated with a library of small molecule and antibody perturbagens. Dataset 1 of 4: Relative cell counts and normalized growth rate inhibition values across technical replicates. - Dataset (ID:20268)
Download: Excel (XLSX), Comma-separated (CSV)
Cell | Clinical Subtype | Transcriptional Subtype | Small Molecule | Antibody | Perturbagen Target | Perturbagen Class | Perturbagen Concentration | Perturbagen Conc Unit | Biological Replicate ID | Relative Cell Count | Normalized Growth Rate Inhibition Value | Nominal Division Rate |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
184B5 | NM | Basal | Nelfinavir | 0.00213 | uM | 12979.174 | 0.9351 | 0.9162 | 1.5680 | |||
184B5 | NM | Basal | Nelfinavir | 0.0107 | uM | 12979.174 | 1.1044 | 1.1307 | 1.5680 | |||
184B5 | NM | Basal | Nelfinavir | 0.0533 | uM | 12979.174 | 1.1707 | 1.2115 | 1.5680 | |||
184B5 | NM | Basal | Nelfinavir | 0.267 | uM | 12979.174 | 1.0987 | 1.1238 | 1.5680 | |||
184B5 | NM | Basal | Nelfinavir | 1.33 | uM | 12979.174 | 0.9779 | 0.9716 | 1.5680 | |||
184B5 | NM | Basal | Nelfinavir | 6.67 | uM | 12979.174 | 0.4979 | 0.2819 | 1.5680 | |||
184B5 | NM | Basal | Nelfinavir | 33.3 | uM | 12979.174 | 0.0397 | -0.7445 | 1.5680 | |||
21MT-1 | HER2amp | - | Nelfinavir | 0.0000853 | uM | 13719.174 | 0.9842 | 0.9613 | 0.8124 | |||
21MT-1 | HER2amp | - | Nelfinavir | 0.000427 | uM | 13719.174 | 0.9754 | 0.9396 | 0.8124 | |||
21MT-1 | HER2amp | - | Nelfinavir | 0.00213 | uM | 13719.174 | 0.9827 | 0.9576 | 0.8124 | |||
21MT-1 | HER2amp | - | Nelfinavir | 0.0107 | uM | 13719.174 | 0.9900 | 0.9753 | 0.8124 | |||
21MT-1 | HER2amp | - | Nelfinavir | 0.0533 | uM | 13719.174 | 0.9894 | 0.9740 | 0.8124 | |||
21MT-1 | HER2amp | - | Nelfinavir | 0.267 | uM | 13719.174 | 0.9788 | 0.9479 | 0.8124 | |||
21MT-1 | HER2amp | - | Nelfinavir | 1.33 | uM | 13719.174 | 0.9804 | 0.9518 | 0.8124 | |||
21MT-1 | HER2amp | - | Nelfinavir | 6.67 | uM | 13719.174 | 0.9565 | 0.8934 | 0.8124 | |||
21MT-1 | HER2amp | - | Nelfinavir | 33.3 | uM | 13719.174 | 0.0489 | -0.9513 | 0.8124 | |||
21NT | HER2amp | - | Nelfinavir | 0.0000853 | uM | 13575.174 | 0.9813 | 0.9763 | 1.5845 | |||
21NT | HER2amp | - | Nelfinavir | 0.000427 | uM | 13575.174 | 0.9718 | 0.9642 | 1.5845 | |||
21NT | HER2amp | - | Nelfinavir | 0.00213 | uM | 13575.174 | 0.9539 | 0.9413 | 1.5845 | |||
21NT | HER2amp | - | Nelfinavir | 0.0107 | uM | 13575.174 | 0.9962 | 0.9952 | 1.5845 | |||
21NT | HER2amp | - | Nelfinavir | 0.0533 | uM | 13575.174 | 0.9863 | 0.9827 | 1.5845 | |||
21NT | HER2amp | - | Nelfinavir | 0.267 | uM | 13575.174 | 0.9831 | 0.9786 | 1.5845 | |||
21NT | HER2amp | - | Nelfinavir | 1.33 | uM | 13575.174 | 0.9806 | 0.9754 | 1.5845 | |||
21NT | HER2amp | - | Nelfinavir | 6.67 | uM | 13575.174 | 0.9885 | 0.9855 | 1.5845 | |||
21NT | HER2amp | - | Nelfinavir | 33.3 | uM | 13575.174 | 0.2300 | -0.2090 | 1.5845 |