Growth rate-corrected (GR) dose-response metrics across a panel of 71 breast cancer cell lines treated with a library of small molecule and antibody perturbagens. Dataset 1 of 4: Relative cell counts and normalized growth rate inhibition values across technical replicates. - Dataset (ID:20268)
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| Cell | Clinical Subtype | Transcriptional Subtype | Small Molecule | Antibody | Perturbagen Target | Perturbagen Class | Perturbagen Concentration | Perturbagen Conc Unit | Biological Replicate ID | Relative Cell Count | Normalized Growth Rate Inhibition Value | Nominal Division Rate |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MDA-MB-453 | TNBC | Luminal | Nelfinavir | 0.000427 | uM | 13562.174 | 0.9987 | 0.9965 | 0.7219 | |||
| MDA-MB-453 | TNBC | Luminal | Nelfinavir | 0.00213 | uM | 13562.174 | 0.9663 | 0.9073 | 0.7219 | |||
| MDA-MB-453 | TNBC | Luminal | Nelfinavir | 0.0107 | uM | 13562.174 | 0.9948 | 0.9856 | 0.7219 | |||
| MDA-MB-453 | TNBC | Luminal | Nelfinavir | 0.0533 | uM | 13562.174 | 1.0003 | 1.0007 | 0.7219 | |||
| MDA-MB-453 | TNBC | Luminal | Nelfinavir | 0.267 | uM | 13562.174 | 0.9806 | 0.9465 | 0.7219 | |||
| MDA-MB-453 | TNBC | Luminal | Nelfinavir | 1.33 | uM | 13562.174 | 1.0035 | 1.0097 | 0.7219 | |||
| MDA-MB-453 | TNBC | Luminal | Nelfinavir | 6.67 | uM | 13562.174 | 0.9335 | 0.8181 | 0.7219 | |||
| MDA-MB-453 | TNBC | Luminal | Nelfinavir | 33.3 | uM | 13562.174 | 0.6623 | 0.1303 | 0.7219 | |||
| MX1 | Unknown | Unknown | Nelfinavir | 0.0000853 | uM | 12667.174 | 1.0167 | 1.0413 | 0.8129 | |||
| MX1 | Unknown | Unknown | Nelfinavir | 0.000427 | uM | 12667.174 | 1.0194 | 1.0478 | 0.8129 | |||
| MX1 | Unknown | Unknown | Nelfinavir | 0.00213 | uM | 12667.174 | 1.0185 | 1.0456 | 0.8129 | |||
| MX1 | Unknown | Unknown | Nelfinavir | 0.0107 | uM | 12667.174 | 1.0174 | 1.0429 | 0.8129 | |||
| MX1 | Unknown | Unknown | Nelfinavir | 0.0533 | uM | 12667.174 | 1.0043 | 1.0107 | 0.8129 | |||
| MX1 | Unknown | Unknown | Nelfinavir | 0.267 | uM | 12667.174 | 0.9829 | 0.9580 | 0.8129 | |||
| MX1 | Unknown | Unknown | Nelfinavir | 1.33 | uM | 12667.174 | 0.9344 | 0.8398 | 0.8129 | |||
| MX1 | Unknown | Unknown | Nelfinavir | 6.67 | uM | 12667.174 | 0.8112 | 0.5460 | 0.8129 | |||
| MX1 | Unknown | Unknown | Nelfinavir | 33.3 | uM | 12667.174 | 0.0464 | -0.9543 | 0.8129 | |||
| SK-BR-3 | HER2amp | Luminal | Nelfinavir | 0.0000853 | uM | 12999.174 | 1.0062 | 1.0149 | 0.8315 | |||
| SK-BR-3 | HER2amp | Luminal | Nelfinavir | 0.000427 | uM | 12999.174 | 0.9907 | 0.9775 | 0.8315 | |||
| SK-BR-3 | HER2amp | Luminal | Nelfinavir | 0.00213 | uM | 12999.174 | 1.0135 | 1.0326 | 0.8315 | |||
| SK-BR-3 | HER2amp | Luminal | Nelfinavir | 0.0107 | uM | 12999.174 | 0.9626 | 0.9104 | 0.8315 | |||
| SK-BR-3 | HER2amp | Luminal | Nelfinavir | 0.0533 | uM | 12999.174 | 0.9594 | 0.9026 | 0.8315 | |||
| SK-BR-3 | HER2amp | Luminal | Nelfinavir | 0.267 | uM | 12999.174 | 0.9639 | 0.9134 | 0.8315 | |||
| SK-BR-3 | HER2amp | Luminal | Nelfinavir | 1.33 | uM | 12999.174 | 0.9491 | 0.8782 | 0.8315 | |||
| SK-BR-3 | HER2amp | Luminal | Nelfinavir | 6.67 | uM | 12999.174 | 0.8299 | 0.5982 | 0.8315 |